Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HARSP12081 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HARSP12081 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HARSP12081 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HARSP12081 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HARSP12081 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HARSP12081 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HARSP12081 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HARSP12081 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HARSP12081 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HARSP12081 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HARSP12081 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HARSP12081 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HARSP12081 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARSP12081 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARSP12081 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARSP12081 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARSP12081 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARSP12081 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARSP12081 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HARSP12081 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HARSP12081 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HARSP12081 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HARSP12081 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HARSP12081 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HARSP12081 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HARSP12081 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HARSP12081 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HARSP12081 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HARSP12081 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HARSP12081 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HARSP12081 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HARSP12081 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HARSP12081 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HARSP12081 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HARSP12081 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HARSP12081 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HARSP12081 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HARSP12081 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HARSP12081 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HARSP12081 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARSP12081 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARSP12081 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARSP12081 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARSP12081 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARSP12081 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARSP12081 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HARSP12081 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HARSP12081 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HARSP12081 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HARSP12081 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HARSP12081 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HARSP12081 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HARSP12081 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HARSP12081 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HARSP12081 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HARSP12081 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HARSP12081 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HARSP12081 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HARSP12081 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HARSP12081 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HARSP12081 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HARSP12081 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HARSP12081 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HARSP12081 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HARSP12081 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HARSP12081 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HARSP12081 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HARSP12081 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HARSP12081 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HARSP12081 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HARSP12081 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HARSP12081 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HARSP12081 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HARSP12081 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HARSP12081 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HARSP12081 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HARSP12081 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HARSP12081 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HARSP12081 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HARSP12081 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HARSP12081 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HARSP12081 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HARSP12081 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HARSP12081 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HARSP12081 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HARSP12081 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms