Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
TOP2AP11388 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC42.99■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
TOP2AP11388 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
TOP2AP11388 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC42.87■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC42.84■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC42.83■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
TOP2AP11388 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC42.78■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC42.78■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.77■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TOP2AP11388 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
TOP2AP11388 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC42.71■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms