Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LYNX1P0DP58 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LYNX1P0DP58 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LYNX1P0DP58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms