Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSH2P0DML3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CSH2P0DML3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CSH2P0DML3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CSH2P0DML3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms