Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RGPD1P0DJD0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RGPD1P0DJD0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
RGPD1P0DJD0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RGPD1P0DJD0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms