Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC2BP0DI82 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC2BP0DI82 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms