Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T8

TMEM253, Transmembrane protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM253P0C7T8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM253P0C7T8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM253P0C7T8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM253P0C7T8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM253P0C7T8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM253P0C7T8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM253P0C7T8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM253P0C7T8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM253P0C7T8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM253P0C7T8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM253P0C7T8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM253P0C7T8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM253P0C7T8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM253P0C7T8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms