Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT19P08727 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT19P08727 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT19P08727 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT19P08727 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT19P08727 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT19P08727 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT19P08727 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT19P08727 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT19P08727 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT19P08727 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT19P08727 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT19P08727 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT19P08727 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT19P08727 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT19P08727 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT19P08727 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT19P08727 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT19P08727 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT19P08727 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT19P08727 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT19P08727 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT19P08727 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT19P08727 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT19P08727 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT19P08727 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT19P08727 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT19P08727 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT19P08727 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT19P08727 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms