Protein–RNA interactions for Protein: P08727

KRT19, Keratin, type I cytoskeletal 19, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT19P08727 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT19P08727 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT19P08727 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRT19P08727 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT19P08727 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT19P08727 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT19P08727 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KRT19P08727 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT19P08727 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT19P08727 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT19P08727 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT19P08727 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KRT19P08727 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT19P08727 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KRT19P08727 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT19P08727 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KRT19P08727 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KRT19P08727 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KRT19P08727 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KRT19P08727 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT19P08727 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT19P08727 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KRT19P08727 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KRT19P08727 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT19P08727 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT19P08727 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KRT19P08727 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT19P08727 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT19P08727 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT19P08727 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT19P08727 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT19P08727 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT19P08727 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT19P08727 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT19P08727 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT19P08727 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT19P08727 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT19P08727 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT19P08727 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms