Protein–RNA interactions for Protein: P08047

SP1, Transcription factor Sp1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP1P08047 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SP1P08047 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP1P08047 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP1P08047 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP1P08047 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP1P08047 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP1P08047 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP1P08047 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SP1P08047 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP1P08047 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP1P08047 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP1P08047 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP1P08047 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP1P08047 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SP1P08047 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP1P08047 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP1P08047 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP1P08047 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP1P08047 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP1P08047 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP1P08047 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP1P08047 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP1P08047 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP1P08047 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP1P08047 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SP1P08047 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP1P08047 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP1P08047 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP1P08047 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP1P08047 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP1P08047 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP1P08047 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SP1P08047 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SP1P08047 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP1P08047 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP1P08047 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP1P08047 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP1P08047 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP1P08047 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP1P08047 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SP1P08047 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SP1P08047 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SP1P08047 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SP1P08047 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SP1P08047 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SP1P08047 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SP1P08047 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SP1P08047 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SP1P08047 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SP1P08047 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SP1P08047 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SP1P08047 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SP1P08047 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SP1P08047 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SP1P08047 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP1P08047 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP1P08047 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP1P08047 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP1P08047 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP1P08047 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SP1P08047 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SP1P08047 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SP1P08047 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SP1P08047 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP1P08047 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP1P08047 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP1P08047 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP1P08047 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP1P08047 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SP1P08047 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP1P08047 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP1P08047 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP1P08047 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP1P08047 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP1P08047 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP1P08047 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SP1P08047 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SP1P08047 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SP1P08047 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP1P08047 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP1P08047 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP1P08047 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP1P08047 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP1P08047 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP1P08047 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SP1P08047 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP1P08047 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP1P08047 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SP1P08047 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms