Protein–RNA interactions for Protein: P07864

LDHC, L-lactate dehydrogenase C chain, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHCP07864 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDHCP07864 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDHCP07864 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LDHCP07864 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDHCP07864 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDHCP07864 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDHCP07864 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LDHCP07864 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHCP07864 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHCP07864 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHCP07864 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHCP07864 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHCP07864 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LDHCP07864 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHCP07864 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHCP07864 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHCP07864 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHCP07864 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHCP07864 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHCP07864 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHCP07864 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHCP07864 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHCP07864 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHCP07864 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LDHCP07864 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LDHCP07864 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LDHCP07864 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LDHCP07864 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LDHCP07864 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDHCP07864 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDHCP07864 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDHCP07864 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LDHCP07864 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LDHCP07864 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LDHCP07864 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LDHCP07864 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LDHCP07864 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LDHCP07864 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHCP07864 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHCP07864 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LDHCP07864 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LDHCP07864 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LDHCP07864 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LDHCP07864 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDHCP07864 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDHCP07864 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LDHCP07864 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHCP07864 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHCP07864 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHCP07864 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHCP07864 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHCP07864 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LDHCP07864 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHCP07864 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHCP07864 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHCP07864 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHCP07864 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHCP07864 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHCP07864 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHCP07864 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LDHCP07864 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDHCP07864 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDHCP07864 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDHCP07864 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDHCP07864 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDHCP07864 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDHCP07864 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDHCP07864 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDHCP07864 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LDHCP07864 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDHCP07864 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDHCP07864 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDHCP07864 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LDHCP07864 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHCP07864 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHCP07864 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHCP07864 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHCP07864 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHCP07864 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHCP07864 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHCP07864 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHCP07864 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHCP07864 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LDHCP07864 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHCP07864 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHCP07864 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHCP07864 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHCP07864 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHCP07864 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHCP07864 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHCP07864 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LDHCP07864 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDHCP07864 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDHCP07864 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LDHCP07864 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDHCP07864 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDHCP07864 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDHCP07864 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDHCP07864 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LDHCP07864 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms