Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASS1P00966 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASS1P00966 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASS1P00966 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASS1P00966 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASS1P00966 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASS1P00966 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASS1P00966 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ASS1P00966 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ASS1P00966 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASS1P00966 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASS1P00966 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASS1P00966 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASS1P00966 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASS1P00966 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASS1P00966 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ASS1P00966 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASS1P00966 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ASS1P00966 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASS1P00966 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASS1P00966 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASS1P00966 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ASS1P00966 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASS1P00966 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ASS1P00966 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASS1P00966 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ASS1P00966 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ASS1P00966 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASS1P00966 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASS1P00966 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASS1P00966 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ASS1P00966 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASS1P00966 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ASS1P00966 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASS1P00966 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASS1P00966 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASS1P00966 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASS1P00966 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASS1P00966 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ASS1P00966 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASS1P00966 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASS1P00966 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASS1P00966 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASS1P00966 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASS1P00966 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASS1P00966 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ASS1P00966 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASS1P00966 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASS1P00966 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASS1P00966 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASS1P00966 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ASS1P00966 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ASS1P00966 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASS1P00966 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASS1P00966 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASS1P00966 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASS1P00966 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ASS1P00966 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASS1P00966 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ASS1P00966 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASS1P00966 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASS1P00966 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASS1P00966 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ASS1P00966 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASS1P00966 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ASS1P00966 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASS1P00966 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASS1P00966 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASS1P00966 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASS1P00966 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ASS1P00966 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASS1P00966 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASS1P00966 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASS1P00966 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASS1P00966 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASS1P00966 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASS1P00966 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ASS1P00966 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASS1P00966 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASS1P00966 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ASS1P00966 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ASS1P00966 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASS1P00966 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASS1P00966 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASS1P00966 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASS1P00966 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASS1P00966 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASS1P00966 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASS1P00966 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms