Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL1O95922 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL1O95922 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TTLL1O95922 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TTLL1O95922 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms