Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GGPS1O95749 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GGPS1O95749 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GGPS1O95749 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGPS1O95749 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGPS1O95749 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGPS1O95749 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGPS1O95749 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGPS1O95749 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GGPS1O95749 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GGPS1O95749 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GGPS1O95749 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GGPS1O95749 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGPS1O95749 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGPS1O95749 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms