Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CPNE6O95741 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPNE6O95741 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CPNE6O95741 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms