Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KIF4AO95239 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KIF4AO95239 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KIF4AO95239 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms