Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE4BO95155 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE4BO95155 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
UBE4BO95155 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms