Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM13AO94988 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM13AO94988 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM13AO94988 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM13AO94988 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms