Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP1O94782 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP1O94782 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP1O94782 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP1O94782 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP1O94782 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP1O94782 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP1O94782 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP1O94782 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP1O94782 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP1O94782 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP1O94782 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP1O94782 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP1O94782 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP1O94782 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP1O94782 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP1O94782 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP1O94782 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP1O94782 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP1O94782 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP1O94782 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP1O94782 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP1O94782 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP1O94782 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP1O94782 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP1O94782 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP1O94782 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP1O94782 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP1O94782 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP1O94782 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP1O94782 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP1O94782 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP1O94782 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP1O94782 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP1O94782 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP1O94782 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP1O94782 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP1O94782 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP1O94782 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP1O94782 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP1O94782 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP1O94782 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP1O94782 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP1O94782 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP1O94782 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP1O94782 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP1O94782 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP1O94782 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP1O94782 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP1O94782 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP1O94782 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP1O94782 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP1O94782 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP1O94782 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP1O94782 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP1O94782 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP1O94782 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP1O94782 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP1O94782 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP1O94782 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP1O94782 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP1O94782 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP1O94782 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP1O94782 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP1O94782 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP1O94782 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP1O94782 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP1O94782 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP1O94782 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP1O94782 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP1O94782 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP1O94782 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP1O94782 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP1O94782 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP1O94782 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms