Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH16O75452 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH16O75452 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH16O75452 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH16O75452 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH16O75452 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH16O75452 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH16O75452 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH16O75452 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH16O75452 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH16O75452 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH16O75452 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH16O75452 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH16O75452 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH16O75452 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH16O75452 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH16O75452 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH16O75452 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH16O75452 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH16O75452 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH16O75452 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH16O75452 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH16O75452 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH16O75452 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH16O75452 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH16O75452 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH16O75452 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH16O75452 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH16O75452 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH16O75452 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH16O75452 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH16O75452 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH16O75452 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH16O75452 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH16O75452 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH16O75452 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH16O75452 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH16O75452 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH16O75452 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH16O75452 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH16O75452 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH16O75452 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH16O75452 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH16O75452 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH16O75452 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH16O75452 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH16O75452 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH16O75452 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH16O75452 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH16O75452 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH16O75452 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH16O75452 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH16O75452 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH16O75452 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH16O75452 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH16O75452 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH16O75452 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH16O75452 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH16O75452 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH16O75452 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH16O75452 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH16O75452 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH16O75452 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH16O75452 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH16O75452 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH16O75452 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RDH16O75452 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH16O75452 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH16O75452 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH16O75452 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH16O75452 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH16O75452 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH16O75452 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH16O75452 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH16O75452 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH16O75452 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH16O75452 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH16O75452 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH16O75452 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH16O75452 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH16O75452 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH16O75452 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH16O75452 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH16O75452 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH16O75452 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH16O75452 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH16O75452 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH16O75452 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH16O75452 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH16O75452 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH16O75452 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH16O75452 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH16O75452 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH16O75452 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH16O75452 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH16O75452 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH16O75452 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH16O75452 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH16O75452 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH16O75452 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms