Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG13O75143 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG13O75143 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG13O75143 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG13O75143 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG13O75143 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG13O75143 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG13O75143 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG13O75143 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG13O75143 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG13O75143 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG13O75143 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG13O75143 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG13O75143 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG13O75143 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG13O75143 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG13O75143 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG13O75143 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATG13O75143 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG13O75143 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG13O75143 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATG13O75143 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG13O75143 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG13O75143 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG13O75143 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG13O75143 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG13O75143 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG13O75143 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG13O75143 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG13O75143 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG13O75143 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG13O75143 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG13O75143 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG13O75143 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG13O75143 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG13O75143 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG13O75143 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG13O75143 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG13O75143 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG13O75143 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG13O75143 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG13O75143 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG13O75143 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG13O75143 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG13O75143 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG13O75143 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG13O75143 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG13O75143 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG13O75143 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG13O75143 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG13O75143 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG13O75143 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG13O75143 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG13O75143 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG13O75143 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG13O75143 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG13O75143 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG13O75143 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG13O75143 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG13O75143 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG13O75143 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG13O75143 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG13O75143 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG13O75143 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG13O75143 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG13O75143 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG13O75143 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG13O75143 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG13O75143 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG13O75143 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG13O75143 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG13O75143 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG13O75143 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG13O75143 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG13O75143 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG13O75143 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG13O75143 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG13O75143 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG13O75143 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG13O75143 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG13O75143 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG13O75143 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG13O75143 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG13O75143 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG13O75143 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG13O75143 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG13O75143 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG13O75143 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG13O75143 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG13O75143 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG13O75143 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG13O75143 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG13O75143 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG13O75143 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG13O75143 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG13O75143 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG13O75143 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG13O75143 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG13O75143 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG13O75143 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms