Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PLXNC1O60486 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
PLXNC1O60486 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
PLXNC1O60486 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PLXNC1O60486 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
PLXNC1O60486 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms