Protein–RNA interactions for Protein: O60243

HS6ST1, Heparan-sulfate 6-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS6ST1O60243 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HS6ST1O60243 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HS6ST1O60243 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HS6ST1O60243 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms