Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUDT21O43809 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUDT21O43809 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUDT21O43809 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUDT21O43809 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms