Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP1G1O43747 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AP1G1O43747 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP1G1O43747 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms