Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCXO43602 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCXO43602 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DCXO43602 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCXO43602 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCXO43602 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCXO43602 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DCXO43602 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCXO43602 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCXO43602 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DCXO43602 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCXO43602 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCXO43602 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DCXO43602 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DCXO43602 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCXO43602 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCXO43602 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCXO43602 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCXO43602 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DCXO43602 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCXO43602 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCXO43602 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DCXO43602 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCXO43602 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCXO43602 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCXO43602 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCXO43602 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCXO43602 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DCXO43602 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCXO43602 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DCXO43602 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DCXO43602 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCXO43602 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCXO43602 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCXO43602 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCXO43602 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCXO43602 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCXO43602 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DCXO43602 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
DCXO43602 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCXO43602 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCXO43602 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCXO43602 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCXO43602 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCXO43602 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DCXO43602 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCXO43602 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCXO43602 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCXO43602 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCXO43602 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCXO43602 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCXO43602 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCXO43602 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCXO43602 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DCXO43602 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCXO43602 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DCXO43602 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DCXO43602 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DCXO43602 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DCXO43602 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DCXO43602 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCXO43602 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DCXO43602 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCXO43602 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCXO43602 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCXO43602 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCXO43602 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCXO43602 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCXO43602 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCXO43602 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCXO43602 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DCXO43602 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCXO43602 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCXO43602 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCXO43602 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCXO43602 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCXO43602 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCXO43602 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCXO43602 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCXO43602 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DCXO43602 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCXO43602 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCXO43602 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DCXO43602 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCXO43602 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCXO43602 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DCXO43602 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DCXO43602 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms