Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM1O43490 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM1O43490 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM1O43490 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM1O43490 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM1O43490 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM1O43490 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM1O43490 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM1O43490 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM1O43490 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM1O43490 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM1O43490 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROM1O43490 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM1O43490 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM1O43490 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM1O43490 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM1O43490 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM1O43490 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM1O43490 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM1O43490 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM1O43490 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROM1O43490 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM1O43490 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM1O43490 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM1O43490 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROM1O43490 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM1O43490 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM1O43490 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM1O43490 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM1O43490 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM1O43490 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM1O43490 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROM1O43490 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM1O43490 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM1O43490 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PROM1O43490 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM1O43490 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM1O43490 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM1O43490 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PROM1O43490 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM1O43490 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM1O43490 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM1O43490 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM1O43490 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PROM1O43490 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM1O43490 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM1O43490 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM1O43490 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM1O43490 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM1O43490 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PROM1O43490 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROM1O43490 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROM1O43490 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROM1O43490 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROM1O43490 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROM1O43490 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROM1O43490 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROM1O43490 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROM1O43490 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROM1O43490 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROM1O43490 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PROM1O43490 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROM1O43490 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROM1O43490 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROM1O43490 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROM1O43490 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROM1O43490 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROM1O43490 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROM1O43490 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROM1O43490 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROM1O43490 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROM1O43490 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROM1O43490 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROM1O43490 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROM1O43490 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROM1O43490 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PROM1O43490 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PROM1O43490 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROM1O43490 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PROM1O43490 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PROM1O43490 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PROM1O43490 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PROM1O43490 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROM1O43490 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROM1O43490 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROM1O43490 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROM1O43490 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROM1O43490 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms