Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC16AO15027 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC16AO15027 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC16AO15027 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms