Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF646O15015 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZNF646O15015 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZNF646O15015 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF646O15015 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF646O15015 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF646O15015 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms