Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGRPO00253 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGRPO00253 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGRPO00253 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGRPO00253 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGRPO00253 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGRPO00253 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGRPO00253 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGRPO00253 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGRPO00253 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGRPO00253 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGRPO00253 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGRPO00253 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGRPO00253 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGRPO00253 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGRPO00253 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGRPO00253 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGRPO00253 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGRPO00253 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGRPO00253 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGRPO00253 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGRPO00253 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGRPO00253 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGRPO00253 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AGRPO00253 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGRPO00253 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AGRPO00253 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGRPO00253 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGRPO00253 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGRPO00253 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGRPO00253 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGRPO00253 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGRPO00253 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGRPO00253 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGRPO00253 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGRPO00253 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGRPO00253 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGRPO00253 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGRPO00253 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGRPO00253 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AGRPO00253 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AGRPO00253 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGRPO00253 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGRPO00253 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGRPO00253 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGRPO00253 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGRPO00253 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGRPO00253 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGRPO00253 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGRPO00253 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGRPO00253 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGRPO00253 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGRPO00253 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGRPO00253 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGRPO00253 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGRPO00253 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGRPO00253 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGRPO00253 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGRPO00253 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGRPO00253 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AGRPO00253 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AGRPO00253 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGRPO00253 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGRPO00253 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGRPO00253 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGRPO00253 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGRPO00253 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGRPO00253 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGRPO00253 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGRPO00253 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGRPO00253 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGRPO00253 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGRPO00253 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGRPO00253 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGRPO00253 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGRPO00253 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGRPO00253 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGRPO00253 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGRPO00253 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGRPO00253 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGRPO00253 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGRPO00253 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGRPO00253 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGRPO00253 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGRPO00253 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGRPO00253 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGRPO00253 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGRPO00253 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGRPO00253 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGRPO00253 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGRPO00253 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGRPO00253 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGRPO00253 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGRPO00253 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGRPO00253 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGRPO00253 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGRPO00253 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGRPO00253 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGRPO00253 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGRPO00253 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms