Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEDD8-MDP1E9PL57 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD8-MDP1E9PL57 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms