Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
C9orf172C9J069 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C9orf172C9J069 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C9orf172C9J069 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms