Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM229AB2RXF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM229AB2RXF0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM229AB2RXF0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM229AB2RXF0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM229AB2RXF0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM229AB2RXF0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms