Protein–RNA interactions for Protein: B2RC85

RSPH10B2, Radial spoke head 10 homolog B2, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10B2B2RC85 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH10B2B2RC85 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH10B2B2RC85 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH10B2B2RC85 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RSPH10B2B2RC85 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RSPH10B2B2RC85 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH10B2B2RC85 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH10B2B2RC85 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH10B2B2RC85 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH10B2B2RC85 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RSPH10B2B2RC85 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RSPH10B2B2RC85 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RSPH10B2B2RC85 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RSPH10B2B2RC85 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms