Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC169A6NNP5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC169A6NNP5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC169A6NNP5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms