Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRRM3A6NNA2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRRM3A6NNA2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRRM3A6NNA2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms