Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN24A6NM45 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN24A6NM45 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms