Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM200CA6NKL6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM200CA6NKL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM200CA6NKL6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms