Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW4

LRRC3C, Leucine-rich repeat-containing protein 3C, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3CA6NJW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC3CA6NJW4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC3CA6NJW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC3CA6NJW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC3CA6NJW4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC3CA6NJW4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC3CA6NJW4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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