Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEMP2A6NFY4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEMP2A6NFY4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEMP2A6NFY4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEMP2A6NFY4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms