Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFAP73A6NFT4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CFAP73A6NFT4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP73A6NFT4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms