Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCAF2A6NFQ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCAF2A6NFQ2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1393.3 ms