Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6L3A6NEY3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GOLGA6L3A6NEY3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6L3A6NEY3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms