Protein–RNA interactions for Protein: A5YKK6

CNOT1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT1A5YKK6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNOT1A5YKK6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNOT1A5YKK6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNOT1A5YKK6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNOT1A5YKK6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms