Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RAB19A4D1S5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RAB19A4D1S5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms