Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSAPA4D1B5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSAPA4D1B5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GSAPA4D1B5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSAPA4D1B5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms