Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYK7

TRAV19, T-cell receptor alpha variable 19 (Fragment), humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV19A0A0A6YYK7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRAV19A0A0A6YYK7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAV19A0A0A6YYK7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAV19A0A0A6YYK7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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