Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY99

TNFSF12-TNFSF13, Protein TNFSF12-TNFSF13, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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