Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HOMER3Q9NSC5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms