Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POLR2J2Q9GZM3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms