Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TSSK1BQ9BXA7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TSSK1BQ9BXA7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms